1、百合商標由圖形和百合文字兩部分組成。圖形中的三片子葉一方面象緊密抱合的鱗莖百合，緊密團結；另一方面一個比一個高大象征蓬勃向上的生物形態，蒸蒸日上，體現了生物公司的屬性和特征；圖形的背景是一輪初升的太陽，喻意生物在太陽的照耀下茁壯成長，前途必然光明。

2、文字“百合”的第一種含義是公司名稱的簡稱，第二種“百合”的含義則代表了公司的發展理念，即“納百川匯海，聚百才合一”，體現了公司海納百川的博大胸懷和高遠的志向。

3、圖形加文字，構成了鄭州金百合生物工程有限公司“百合”商標的完整組合。